Presentación
El programa de investigación en Informática Biomédica lleva a cabo investigación fundamental y desarrollos tecnológicos sobre la aplicación de las tecnologías avanzadas de la información y los métodos computacionales en las ciencias de la salud y la vida. Mar Albà es la directora del programa.
El programa tiene una gran experiencia en la participación y coordinación de proyectos de investigación financiados por la Comisión Europea y otros agencias financiadoras. Asimismo, cuenta con una larga tradición de colaboraciones con la industria farmacéutica y biotecnológica en el marco de los proyectos de I + D y en la prestación de servicios, especialmente en el desarrollo de métodos computacionales para el descubrimiento de fármacos.
Los investigadores del programa imparten formación de grado y postgrado en la UPF, dirigiendo el Master de Bioinformática para las Ciencias de la Salud.
El programa está organizado en siete grupos de investigación:
- Desarrollo de fármacos en base a receptores acoplados a proteínas G, que se dedica al estudio de la función de los receptores acoplados a proteína G (GPCRs) en el ámbito de las enfermedades relacionadas con el sistema nervioso central (SNC) . La coordinadora es Jana Selent (Hospital del Mar Research Institute-UPF).
- Epigenética computacional, el grupo está interesado en entender cómo surgen distintos epigenomas, cuán estables son los cambios epigenéticos y cómo conducen a distintos fenotipos. Para responder a estas preguntas, desarrollamos métodos computacionales y modelos matemáticos que permiten identificar qué regiones del epigenoma se alteran bajo distintas condiciones en grandes cantidades de células individuales, y cómo estos cambios afectan al fenotipo observado. Maria Colomé-Tatché es la coordinadora del grupo.
- FarmacoInformática, un grupo centrado en el desarrollo y la aplicación de métodos informáticos dirigidos al descubrimiento y desarrollo de nuevos fármacos. Manuel Pastor (UPF-Hospital del Mar Research Institute) es el coordinador del grupo. Ismael Zamora (UPF), director del Lead Molecular Design, colabora con el grupo.
- Genómica comparada y funcional, se centra en aplicar las últimas técnicas genómicas y la gran cantidad de datos genómicos disponibles para caracterizar la variación genética entre individuos y especies y cómo se traducen en diferencias en el fenotipo y la susceptibilidad a enfermedades. Su coordinador es Mario Cáceres (Hospital del Mar Research Institute – ICREA).
- Genómica evolutiva, que se centra en la utilización de la genómica comparativa y el análisis de datos a gran escala con el objetivo de comprender la evolución de genes y genomas y la predicción de elementos funcionales. Mar Albà (Hospital del Mar Research Institute-UPF-ICREA) es la coordinadora del grupo.
- Informática biomédica integrada, un grupo singular especialmente dedicado a la generación y realización de iniciativas de investigación que intenta contribuir a la solución de los problemas biomédicos sobre la base de la aplicación conjunta de métodos y estrategias permitidas en los diferentes laboratorios. Ferran Sanz (Hospital del Mar Research Institute-UPF) es el coordinador del grupo.
- Neurogenómica, tiene como objetivo conocer los mecanismos evolutivos que dan lugar a las especializaciones del cerebro humano mediante la genómica funcional. Gabriel Santpere (Hospital del Mar Research Institute-UPF) es el coordinador del grupo.
El Programa coordina junto con Farmaindustria la Plataforma Tecnológica Española de Medicamentos Innovadores (PTEMI) y es uno the los nodos de la plataforma IMPaCT DATA del ISCIII. El GRIB participa en la Asociacion Bioinformatics Barcelona (BIB), que tiene como objetivo promover la formación, la investigación y la transferencia de tecnología en el campo de la bioinformática. Ferran Sanz, IP del programa, es copresidente de la PTEMI y vicepresidente del BIB.
El programa está ubicado en el Parque de Investigación Biomédica de Barcelona (PRBB) donde trabajan varios programas y grupos de investigación en Biología Computacional e Informática Biomédica. La colaboración con científicos de estos grupos es frecuente y muy productiva.
La actividad de investigación del GRIB ha originado de un gran número de software científico así como la creación de varias empresas spin-off: MedBioinformatics Solutions, creada por Ferran Sanz y Laura I Furlong y Chemotargets, creada por Jordi Mestres.